Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrioQ0KL02 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms