Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms