Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf541Q0GGX2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms