Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnnm1Q0GA42 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms