Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MitfQ08874 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms