Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
MestQ07646 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms