Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
AmbpQ07456 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmbpQ07456 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms