Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms