Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Apoc2Q05020 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms