Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cdk18Q04899 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms