Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccl7Q03366 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms