Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxd1Q01822 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms