Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rbp4Q00724 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms