Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SeleQ00690 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms