Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms