Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou1f1Q00286 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pou1f1Q00286 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Pou1f1Q00286 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Pou1f1Q00286 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou1f1Q00286 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms