Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms