Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ptprn2P80560 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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