Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx2P80206 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms