Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpl23aP62751 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpl23aP62751 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms