Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rps11P62281 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms