Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga11P61622 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Itga11P61622 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Itga11P61622 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms