Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ube2nP61089 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms