Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms