Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn18P56857 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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