Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms