Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

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Length 788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CastP51125 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CastP51125 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CastP51125 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms