Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms