Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VdrP48281 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VdrP48281 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VdrP48281 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VdrP48281 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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VdrP48281 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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