Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms