Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms