Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms