Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sept1P42209 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sept1P42209 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sept1P42209 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sept1P42209 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms