Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tnfsf9P41274 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms