Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms