Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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