Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprmP28828 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprmP28828 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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