Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Dusp1P28563 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms