Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms