Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RarbP22605 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RarbP22605 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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