Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pou3f1P21952 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pou3f1P21952 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms