Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Prim1P20664 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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