Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnnc1P19123 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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