Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sdc1P18828 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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