Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtpraP18052 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtpraP18052 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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