Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxb1P17919 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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