Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sptan1P16546 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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