Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms