Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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DmdP11531 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DmdP11531 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DmdP11531 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DmdP11531 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DmdP11531 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DmdP11531 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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DmdP11531 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DmdP11531 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms