Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Ifna9P09235 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna9P09235 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms